Útoky na evoluci konzervativních náboženských věřících často zahrnují tvrzení, že neexistuje žádný pevný důkaz pro evoluci, která by se ve skutečnosti kdy objevila. Mnoho lidí je těmito tvrzeními ovlivněno, částečně proto, že zatímco nárok lze učinit dramaticky a snadno, vyvrácení je nutně časově náročné, akademické a mnohem méně dramatické. Pravda je však taková, že existuje dostatek důkazů pro evoluci. Rozdíl mezi analogickými a homologními strukturami poskytuje ateistům (a teistům, kteří přijímají evoluci) zajímavý způsob, jak popsat důkazy evoluce přicházející ze dvou směrů.
Analogové / konvergentní struktury
Některé biologické charakteristiky jsou analogické (také nazývané „konvergentní“), což znamená, že slouží stejné funkci u různých druhů, ale vyvinuly se nezávisle, nikoli ze stejného embryologického materiálu nebo ze stejných struktur ve společném předku. Příkladem analogické struktury by byla křídla motýlů, netopýrů a ptáků.
Dalším důležitým příkladem by byl vývoj oka typu kamery u měkkýšů a obratlovců. Tento příklad analogických struktur je zvláště užitečný, protože jedním z nejběžnějších tvrzení náboženských kreacionistů je to, že se něco tak složitého jako oko nemohlo přirozeně vyvinout - trvají na tom, že jediným proveditelným vysvětlením je nadpřirozený návrhář (který je vždy jejich bůh, i když to zřídka připouštějí).
Skutečnost, že oči u různých druhů jsou analogickými strukturami, dokazuje nejen to, že se oko může vyvíjet přirozeně, ale že se ve skutečnosti vyvíjelo i několikrát, nezávisle a poněkud odlišným způsobem. Totéž platí i pro jiné analogické struktury, a to proto, že určité funkce (jako je schopnost vidět) jsou právě tak užitečné, že je nevyhnutelné, že se nakonec vyvinou. Žádné nadpřirozené bytosti, ať už bohové nebo ne, nejsou nutné k vysvětlení nebo pochopení toho, jak se oči vyvíjely vícekrát.
Homologické struktury
Homologické struktury jsou naproti tomu vlastnosti, které jsou sdíleny příbuznými druhy, protože byly nějakým způsobem zděděny od společného předka. Například kosti na předních ploutvích velryby jsou homologní ke kostem v lidské paži a obě jsou homologní ke kostem v rameni šimpanze. Kosti ve všech těchto různých částech těla na různých zvířatech jsou v zásadě stejné kosti, ale jejich velikost je různá a slouží zvířatům, kde se nacházejí, mírně odlišné funkce.
Homologické struktury poskytují důkaz evoluce, protože umožňují biologům sledovat evoluční cestu různých druhů a spojovat je ve větším evolučním stromu, který spojuje veškerý život zpět se společným předkem. Takové struktury jsou také silným důkazem proti kreacionismu a inteligentnímu designu: pokud existovalo božstvo, které vytvořilo všechny různé druhy, proč používat stejné základní části znovu a znovu v různých tvorech pro různé funkce? Proč nepoužívat zcela nové díly, které jsou speciálně navrženy pro specifické a odlišné účely?
Určitě by mohla být vytvořena „dokonalejší ruka“ a „dokonalejší ploutev“, pokud by byla založena na částech navržených pro jejich konkrétní účel. Naopak, ve skutečnosti máme nedokonalé části těla a jsou částečně nedokonalé, protože všechny pocházejí z kostí, které původně existovaly z jiných důvodů úplně. Kosti byly po dlouhou dobu přizpůsobeny pro nové účely, které potřebovaly, aby jen stěží uspěly. Evoluce vyžaduje pouze to, aby jeden byl lepší než konkurence, nikoli ten nejlepší, co je teoreticky možné. To je důvod, proč nedokonalé vlastnosti a struktury jsou v přírodním světě normou.
Ve skutečnosti lze říci, že celý biologický svět je složen z homologních struktur: celý život je založen na stejných typech nukleotidů a stejných aminokyselinách. Proč? Perfektní a inteligentní designér by mohl snadno vytvořit život z celé řady aminokyselin a struktur DNA, vše speciálně vhodné pro konkrétní účely. Přítomnost stejných chemických struktur v celém životě je důkazem toho, že celý život je ve spojení a vyvíjí se od společného předka. Vědecké důkazy jsou jednoznačné: žádný bohové ani jiní konstruktéři neměli ruku v rozvoji života obecně nebo zvláště lidského života. Jsme tím, čím jsme, kvůli našemu evolučnímu dědictví, ne kvůli touhám nebo vůli jakýchkoli božstev.
