Většina zjevných anatomických homologií je mezi anatomickými strukturami, které jsou aktivně používány daným druhem, ale některé anatomické homologie zahrnují struktury, které již nejsou potřeba, ale které také zcela nezmizely. Pozůstatkový orgán nebo struktura je orgán nebo struktura nalezená u druhu, který se nepoužívá jako u jiných druhů. Na rozdíl od všeobecného přesvědčení, zbytkové orgány a zbytkové struktury nemusí být nutně k ničemu nebo bez funkce.
Vestigial neznamená zbytečné nebo nefunkční, protože je obtížné, ne-li nemožné prokázat, že jakákoli konkrétní struktura je nefunkční. Je možné, že některé pozůstatkové orgány jsou nefunkční, ale vědci a biologové tak dogmaticky nepředpokládají. Vše, co je nezbytné pro to, aby byl orgán nebo struktura označen jako „pozůstatkový“, je to, aby existovaly homologie u jiných druhů, u nichž je použití nebo funkce jasné, ale stejné použití nebo funkce neplatí pro dotyčný druh. Použití může být liché, nebo to prostě ještě nemůže být identifikováno.
Velryba pánevní kosti
Příkladem takové struktury je pánev velryb. Všechny tetrapody (včetně velryb) mají pánevní kosti. U většiny zvířat jsou pánevní kosti potřebné k tomu, aby mohly pohybovat dolní nebo zadní sadou končetin za účelem lokomoce. U některých druhů, jako jsou velryby, tyto končetiny z velké části neexistují ačkoli zbytky z nich mohou zůstat.
Navzdory tomuto nedostatku potřeby pro ně mají velryby pánevní kosti. Ve srovnání se svými protějšky u jiných zvířat jsou poměrně malí, ale existují. Možná plní nějakou funkci, například pomáhají podporovat reprodukční anatomii velryby, ale existuje mnoho různých typů struktur, které by byly pro takový úkol vhodnější.
Otázkou je, proč by velryba, která postrádá dolní končetiny a nepotřebuje k pohybu pánevní kosti, měla pánevní kosti, které jsou homologní k tvorům, které potřebují k pohybu pánevní kosti? Podobné homologie existují pro hady a beznohé ještěrky. Jediným vysvětlením, které dává smysl, je opět to, že tato stvoření se vyvinula ze společného předka spolu se všemi ostatními tetrapody.
Lidský dodatek
Dalším běžným (a často nepochopeným) příkladem je dodatek. U lidí má dodatek málo zřejmé funkce, ačkoli se nyní zdá, že může ukládat některé imunitní buňky. Analogický orgán u mnoha jiných druhů však má zjevnou funkci. Kromě toho může být lidský dodatek pozitivně nevýhodný v tom smyslu, že je vystaven nepříjemným infekcím, které mohou být fatální.
Dodatek je pozůstatkový orgán, protože neslouží funkci jako homologní orgány u jiných zvířat, i když by mohl sloužit funkci u lidí. Otázkou tedy je, proč mají lidé dodatek? (Nebo proč lidský dodatek nefunguje jako homologní orgán u jiných zvířat?) Evoluce, myšlenka, že všichni máme společné předky, poskytuje smysluplnou odpověď. Kreacionismus ne.
